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 來源:實驗動物那些事兒 日期:2023.10.10 

如果實驗設計不嚴謹——以漸凍人症(zhèng)轉基因小鼠藥物研發為例

肌萎縮性脊髓側索硬化症

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因中樞神經係統內控製(zhì)骨骼肌(jī)運動的神經元退化導(dǎo)致的肌萎縮性脊髓側索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis: ALS,也稱(chēng)漸凍人症)是一種漸進且致命的神經退行(háng)性疾病。由於運動神經元退化和死亡,肌肉逐漸萎縮致大腦完全喪失控(kòng)製隨意運動的能力,最終會造成發音、吞咽,以及呼吸和運動障礙。著名物理學家霍金就是一名ALS患者。目前還沒有(yǒu)真正可有效治療ALS的藥物和方法。

絕(jué)大(dà)多(duō)數(90-95%)的ALS發病原因不明(míng),但(dàn)也有約5-10%的ALS患者表現出了家(jiā)族遺傳性,其中(zhōng)超氧化物歧化酶 1(Superoxide Dismutase 1:SOD1)基因突變約占這些(xiē)遺傳性ALS病例的10%。SOD1也是(shì)第一個被鑒定出來的ALS風險基(jī)因[1],因此很快(kuài)就有(yǒu)科學(xué)家構建了一(yī)種含有(yǒu)第93位(wèi)甘氨酸突變為丙氨酸(G93A)的人SOD1基因的轉基因小鼠模型,全名為B6SJL-Tg(SOD1*G93A)1Gur/J轉基因小鼠[2]。該轉基因(yīn)小鼠基因組中被轉入了23個拷貝的人源(yuán)SOD1*G93A突變基因,接下來我們將其(qí)簡稱(chēng)SOD1*G93A轉基因小鼠。

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圖二:SOD1*G93A轉基因小鼠是以B6和(hé)SJL雜交子代為(wéi)背景品係,通過原(yuán)核注射和胚胎移(yí)植得到的轉基因小鼠模(mó)型,因此其毛色(sè)多樣,圖片來自(zì)Jax實驗室(https://www.jax.org/strain/002726)

自1996年SOD1*G93A轉基因(yīn)小鼠問世以後,其就被廣(guǎng)泛應(yīng)用(yòng)於ALS藥物研發的臨床前動物試驗中。到2004年,短短8年時間內,已(yǐ)至少有(yǒu)50篇(piān)文章描述了從小分子到(dào)病毒(dú)載體的各類ALS治(zhì)療方案,可延長SOD1*G93A轉基(jī)因小鼠的壽命(mìng),其中最長可以延長壽命(mìng)100天(78%的壽命延長)。這些藥(yào)物很快進(jìn)入臨床試驗,然而,迄今為止,除了利魯唑(最多(duō)延長(zhǎng)ALS患者兩個月壽命)之外,沒有任何一種藥物顯示出對人類(lèi)ALS疾病的進程有顯著影響[3]。這給醫藥公司帶來(lái)了巨大損失,如2008年在(zài)美國國家科學院院刊上發表的一篇文章顯示鋰可(kě)以(yǐ)將(jiāng)SOD1*G93A轉基因小鼠的存活時間延長30天[4]。由於鋰早已經被用於治療精神(shén)分裂症,許多ALS患者開始超說明書服(fú)用該藥物,希望減緩疾病進程。然而,招募了數百名患者,花費了遠超1億美元的(de)三個(gè)同時啟動的獨立(lì)III期臨床試驗結果(guǒ)卻顯示鋰對ALS無任何(hé)治療效果。

其實(shí)不僅僅是ALS的藥物研發,在整個醫藥研發領域,動物(wù)實驗結果(guǒ)的(de)平均(jun1)臨(lín)床轉化率也是非常低的,平均(jun1)在11%左右  。那麽到底是什麽原因導致了如此高比(bǐ)例的動物實(shí)驗結果無法實現在人類的(de)臨床轉(zhuǎn)化呢?

1999年,美國麻省理工學院的機(jī)械工程師詹姆(mǔ)斯·海伍德在得知他的哥哥史蒂芬(fēn)·海伍德被確診患有ALS,並無任何(hé)有效(xiào)治療方法後,與家人一起創立了一家非盈利性生物技術公司,即ALS 治(zhì)療開發研究所 (ALS-TDI)。ALS-TDI成立後(hòu)開展了一項(xiàng)旨在(zài)尋找SOD1*G93A轉基因小(xiǎo)鼠實驗結果臨床轉化失敗原因的(de)項目,即使用SOD1*G93A轉基因小鼠重複已發(fā)表(biǎo)科研論文中的動物實驗,以找出其(qí)臨床轉化失敗的原因。

在ALS-TDI開(kāi)展的重複性實驗中,他們不僅嚴格執行盲法對照,而且對(duì)給藥(yào)組(zǔ)和對照組的動物進行了更為(wéi)精細的分配和動物篩查(chá)以(yǐ)排(pái)除係統誤差。他們分組及實(shí)驗要求包括:

⑴ 年齡(líng)匹配;

⑵ 性別匹配;

⑶ 同窩匹配:即使用同一天出生的同一非轉基因母親和轉基因(yīn)父親的後代進行分組(zǔ),具體來說,治療組中的每個雄性(和雌性)在對照組中都有(yǒu)一(yī)個(gè)同窩兄弟(和姐妹);

⑷ 樣本量設(shè)定(dìng):每(měi)組使用動物數量為24隻(zhī)(12雌,12雄(xióng));

⑸ 死因篩查:檢查記錄每一隻動物的死亡原因,排出非ALS致(zhì)死個體(tǐ);

⑹ 轉基因拷貝數監控:有(yǒu)研究證明SOD1*G93A轉基因小鼠在傳代過程中會(huì)出現轉基因拷貝數丟失的(de)現象(xiàng),且低拷貝的轉基因小鼠的平均壽(shòu)命會加長。

在這一嚴格(gé)實驗分組和動物篩查條件下,ALS-TDI的科研人員總共使(shǐ)用了5429隻SOD1*G93A轉基因小鼠測試了包括利魯唑在內的100多種(大部分已有(yǒu)論文發表並(bìng)證明可延長SOD1*G93A轉基因小鼠壽(shòu)命)候選化合物,卻沒有發現任一化合(hé)物表現出可延長SOD1*G93A轉基因小(xiǎo)鼠壽命的效果(圖三)。

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圖三:ALS-TDI以SOD1*G93A轉基因小鼠(shǔ)開展的重複實驗結果(guǒ)與已(yǐ)發(fā)表實驗結果對(duì)比[3]

為找出導致那(nà)些已經發表實驗結果無法被(bèi)重複的原因,他們以在ALS-TDI開展實驗中所使用的2000多隻對照小鼠作為研究對象,進行了計(jì)算機分組模擬實(shí)驗。由(yóu)於這些小(xiǎo)鼠從出(chū)生(shēng)到死亡及死亡原因(yīn)的信息在ALS-TDI都有詳細的記錄,因此(cǐ)他們能夠以所有對照小鼠為數據庫,分析前述重複實驗中設定的不同分組和動物篩查條件對實驗結(jié)果(guǒ)的影響。即通過計算機對這些沒有經過任何藥物處理(lǐ)的(de)小鼠進行分組,將一組設為假定的實驗組,而另一組設為假定的對照組,然後依(yī)據已有的小鼠死亡時(shí)間記錄,統計兩組小鼠之間是否存(cún)在顯著差異。經過多次重複,計算(suàn)出現5%以上顯著差(chà)異的百分比(bǐ)。由(yóu)於這些對照小鼠沒(méi)有接(jiē)受過任何化合物處理,因此如果假定的實驗(yàn)組和對照組中出現了(le)顯著(zhe)性差異,那麽其來源應該是分組時的係(xì)統(tǒng)誤差。

結果顯示,在樣本量大小為4的計算機分組模擬對比實驗中,在隨機分組和不進(jìn)行(háng)死因篩查及排除低轉基因拷貝數個體條件下,兩(liǎng)組間出現(xiàn)顯(xiǎn)著差(chà)異的可能性超過了50%。而隨(suí)機分組的同時進行死因篩查並排(pái)除低轉基因拷(kǎo)貝數個體(tǐ)和進行性別(bié)匹配的(de)分組條件下,樣本量為4的模擬分組實驗中也有30%的可能出現兩組死(sǐ)亡時間的顯著差異(圖四)。隨著樣本量的增加,出現顯著性差異的可能性逐漸減少,但要實現低於(yú)5%(統計學上通常設置的顯著置信區間)的顯著性差異(yì),樣本量要達到每組24隻動物。如(rú)果不做分組條件控製,即使樣本量到(dào)50隻也難以(yǐ)排除係統誤差。

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圖四:分組條件導致的係統誤差[3]

ALS- TDI的這個計算機模擬實驗結果(guǒ)說明,前述那些已經發表的基於SOD1*G93A轉基因(yīn)小鼠(shǔ)實驗結果無法(fǎ)實現臨床轉化的真正原因極大可能源於其實驗設計的不合理。這些實(shí)驗因為沒有排除分組時的係統誤差而導致(zhì)了假陽性結果。這個研究也暴露了當下使用實驗動物開展(zhǎn)研究的諸多問題(tí),如盲目地追求減少使用動(dòng)物的數(shù)量;對所用(yòng)動(dòng)物遺傳、微生物和繁殖等特性不了解;實驗過程中對動物關注不夠,不清楚動物發病或死亡的真正原因等。這些問(wèn)題(tí)不僅僅需要(yào)引起實驗動物從業人員的注意(yì),科研人員同樣需要(yào)給予關注。因為實驗設計不嚴謹導致的假陽性結果不僅(jǐn)是(shì)人力、物力和財力的巨大浪費,也嚴重有違動物實驗倫理福利,這樣的實驗不會帶來科學進步,且浪費了大量實驗動(dòng)物(wù)的生命。比如在ALS-TDI開展(zhǎn)的無法重複出已發表結果的實驗中(zhōng),那些已經發表的工作(zuò)累計使(shǐ)用小鼠的數量就(jiù)超過了18000隻。此外,在動物實驗倫理申請時(shí)常用替代、優化和(hé)減少(shǎo)(俗稱3R原則)原則來指導倫(lún)理審查工作,有時為(wéi)了滿足3R原則中的“減少”原則,加上(shàng)開展實驗成本的考慮,往往選擇使用最少的(de)動物數量(比如(rú)多為每組6隻),但從ALS-TDI的這(zhè)個研究看,樣本量過小(xiǎo),會導致係統誤差加大,因此(cǐ)極大可能出現假陽性結果。這(zhè)個時候大家或許忘了3R原則使用的大前提是要能夠(gòu)實現擬開(kāi)展實驗的科學目標,如果單純為了“減少”而使用更少(shǎo)的實驗動物導致科學目標無法實現,那不是減少,而是對動物生命的漠視。

參考文獻:

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